LI-6800數據分析 | 文章的圖形和照片的拼接也可以用 R 啦

LI-6800高級光合-熒光測量系統

在文章中難免有太多需要拼圖的地方，例如作圖的時(shí)候直接將幾幅圖拼在一起，這種方式的拼圖比較好處理，有大量的軟件包做這個(gè)事情，例如優(yōu)秀的 patchwork，還有一種就是實(shí)驗的拍照，需要拼圖，或者拍照和作圖拼在一起，這種方式我們通常都手動(dòng)處理，實(shí)際上，現在在 R 里也有解決方案了，那就是今天要介紹的 figpatch 軟件包，與 patchwork 是絕配。

安裝

安裝很簡(jiǎn)單，從 CRAN 即可，現在 github 不是那么好用：

要使用還是必須進(jìn)行一如既往的操作：

使用

我這里使用兩次 RACiR 測量的數據，因為這兩個(gè)數據來(lái)源于水稻，所以我網(wǎng)上隨便找了兩個(gè)水稻的圖片，當做兩次測量的植株處理。

先將數據讀入：

后面簡(jiǎn)化操作步驟，用 ggplot2 默認的 loess 方式擬合一下數據，不再進(jìn)行一個(gè)非線(xiàn)性擬合后在寫(xiě)入公式。

與作圖數據進(jìn)行拼圖

實(shí)際上測量時(shí)水稻是種在溫室里相鄰的兩個(gè)水池內，長(cháng)勢也一致，這里只是作為演示用，所以不要誤會(huì )。

拼圖時(shí)圖形我們可以設置長(cháng)寬比，方便我們調整圖形的外觀(guān)，例如下面三個(gè)例子：

標簽

作為標準的科研圖形，加標簽很重要：

拼接照片

拼接照片也很方便：

拼接多個(gè)圖片

如果有大量的圖片，可以先把他們拼接成向量或列表，以及利用相關(guān)參數調整邊距等

添加特定文本

figpatch 實(shí)際上是對圖片進(jìn)行 ggplot2 包裹，他的 fig() 實(shí)際上是 ggplot 對象，labels則是坐標軸 (x 或 y)。因而可以根據這個(gè)來(lái)定制特定文本的顯示。

參考資料鏈接